原理:
聚丙烯酰胺凝胶电泳是以聚丙烯酰胺凝胶为载体停止电泳的方法。核糖核酸(ribonucleicacid,RNA)分子在一定pH值的缓冲液中带有电荷,将其放人电场中,则可向与其所带电荷电性相反的电极移动。聚丙烯酰胺凝胶具有分子筛效应,核酸分子大小、外形不同,故在电场作用下,核酸分子在聚丙烯酰胺凝胶中泳动速度不同,依此可到达分别纯化的自的。本文详细引见了RNA的聚丙烯酰胺凝胶电泳,包括聚丙烯酰胺凝胶电泳的原理,实验所需试剂,实验步骤。
资料、仪器设备及试剂
(一)资料
RNA样品液。
(二)仪器设备
电泳仪,玻璃管,试管架,穿刺针头,注射器。
(三)试剂
(1) 20%的单体母液:取重结晶的丙烯酰胺19.0g及甲叉双丙烯酰胺1.0g,蒸馏水溶解,稀释至100mL。
(2) Tris-硼酸一EDTA(TBE)缓冲液:称Tris 108.8 g,硼酸55.0g, EDTA -Na29.3g蒸馏水溶解,稀释至1000mL,pH为8.3。用于电极缓冲液时再稀释10倍。
(3) β一DMAPN(二甲基氨基丙腈)。
(4) 1.6%过硫酸铵溶液:称取0.16 g过硫酸铵溶于10 ml.水中。
(5) 20%蔗糖-0.2%溴酚蓝溶液:取蔗糖20g,溴酚蓝0.2 g溶子100 mL水中。
(6) 0.2%甲烯蓝染液:取0.2 g甲烯蓝溶于100 mL pH4.7的0.4 mol/L HAc缓冲液中,过滤后运用。
(7) 6%HAc液:取HAc 60 mL加水至1 000 mL。
RNA的聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤:
(一)制胶
(1)取玻管(8 cmx0.5 cm)2支,下端用胶布封锁管口,垂直立在试管架上。
(2)取单体母液3 mL、缓冲液1.5 mL、β- DMAPN0.06 mL、水10 mL混匀,再加过硫酸铵0.94mL,混匀后立郎分装于各管至刻度处,沿玻管加几滴水封面,静置待凝结。
(二)加样
(1)取大批RNA样品液和RNA规范液区分如人等体积的20%蔗糖和0.2%溴酚蓝待用。
(2)剥去凝胶管下端胶布,倒出凝胶外表水,用电泳缓冲液洗濯凝胶外表三次,凝胶管内加满缓冲液,插人电泳槽中,上下槽加足电泳缓冲液,每支凝胶管加rna样品10~ 20 μL(含RNA 50~ 100 μg)。
(三)电泳
接通电泳仪电源,上槽接负极,下槽接正极。末尾时电流应小一些,以每支凝胶1~2mA为宜。待样品进人凝胶后添加至每支凝胶3mA,调至所需电流并坚持。待溴酚蓝迁移至距凝胶管下端2cm处封锁电源中止电泳,取出凝胶管。
(四)染色及观察
(1)用5mL注射器吸满蒸馏水,安上穿刺针头,针尖紧贴玻管壁,边旋边向凝胶管侧壁注入水剥离凝胶。
(2)将凝胶放入染色液中染色1 h,再用6% HAc脱色,改换数次脱色液,直到背景明晰,普通需脱色24h。
(3)将凝胶泡在6%HAc中,取出后在紫外灯下观察,比拟不异样品的电泳区带。
RNA的聚丙烯酰胺凝胶电泳-上海液质检测 DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳引见——万融实验 健明迪检测
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(一)操作规程
1.清洗装配 用去污剂、水洗净玻璃板,晾干。然后依照要求装好。洗濯及装配玻璃板时必需戴手套。
2.制胶 确知玻璃板的大小和距离片的厚度,可以得知所需丙烯酰胺溶液的体积(100mL不同浓度凝胶的制备,参见表2-1)。
表2-1 制备聚丙烯酰胺凝胶所用试剂的体积
3.聚合 立刻拔出适当的梳子。室温下静置聚合5~20分钟。
4.上样 向电泳槽中参与电泳缓冲液,小心拔出梳子。用电泳缓冲液冲洗点样孔。然后上样。
5.电泳 末尾时电压为8V/cm凝胶,染料泳动至胶底约1cm时,中止电泳。
6.剖析 取下凝胶,切除凝胶的一角作为标志。染色、剖析。
(二)留意事项
1.电泳前 ①整个操作进程中必需戴手套,未聚合的丙烯酰胺为神经毒性,可经过皮肤吸收,其作用具累积性。聚合的丙烯酰胺无毒,但也应戴手套,因其能够含有未聚合资料。②灌注凝胶时要防止凝胶的走漏,灌注前可用水测试一下。③一定要反省电极的衔接,正负极要对应。④要先倒电泳缓冲液,然后上样,再设定电泳条件接通电源。⑤调电流电压时,不要超出额外范围。
2.电泳时 ①电泳进程中会发生少量的热,应将电泳槽放入冷藏室或冰上停止电泳。②在电泳进程中,电泳装置如有异常发热,立刻封锁电泳仪。
3.电泳后 取出凝胶时要十分小心,以免凝胶分裂影响剖析。
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