食品微生物检测有哪些 （一）概述：NGS测序在病原微生物检测中的应用 健明迪

经过显微镜直接观察。普通来说，在一定的培育条件下（相反的培育基、温度以及培育时间），同种微生物表现出动摇的菌落特征。这些特征包括菌落的外形、大小、隆起水平和颜色等方面。因此可以经过显微镜观察菌落特征对微生物种类停止判别。接上去健明迪检测为你详细解答，希望可以协助到你。

运用选择培育基培育微生物或人为提供有利于目的菌株生长的条件。选择培育基，望文生义其作用是允许特定种类的微生物生长，同时抑制或阻止其他微生物生长。例如，运用以尿素作为独一氮源的培育基可以培育出可分解脲酶的微生物；在培育基中ph调至酸性有利于霉菌的生长繁衍（抑制细菌的生命活动）等。选择培育普通是经过观察微生物的异化作用类型或某一特征停止直接判别，失掉的微生物往往并不只要一种，但是可以大致确定这些微生物存在的共有特征从而对其分类。

运用鉴别培育基。即依据微生物的代谢特点，在培育基中参与某种指示剂或化学药品。例如，水质检验中大肠杆菌的检验（大肠杆菌的存在数量用以权衡水被粪便污染的水平）就用到了伊红—美蓝试剂，该试剂与水或乳制品中的大肠杆菌反响出现深紫色且带有金属光泽，属于大肠杆菌的特征反响。与选择培育相比，鉴别培育基的鉴别所得结果的范围比拟小，普通可直接测定某微生物的种类。

❝ NGS技术在临床上的运用逐渐趋于成熟，从早期的肿瘤基因检测，到如今大热的微生物病原核酸检测，NGS技术以其快速、准确和高分辨率的特点，发扬着无可替代的作用。 ❞

微生物在地球上无处不在，从陆地到陆地，从衣物到皮肤，甚至我们的身体外部。

繁衍、变异、自然选择和生活妥协，是一切生物必需阅历的。

由于生命的*要义，是生活。

为了生活，必需妥协，生物之间为了争夺资源，以及生物与自然环境之间，都存在着妥协 ，在这个进程中，有些微生物可以与人类战争共处，甚至互利共生，而有的微生物则会使人患病，通常有细菌、真菌、病毒、支原体，以及衣原体，这些就是临床上的病原微生物。

自然选择需求阅历漫长的进程，但是近年来环境污染，药物滥用，加快了病原微生物的退化速度，耐药菌，超级菌的出现，严重要挟着人类安康。

还有一些微生物，原本与人类没有交集，原先只存在于自然界，而有人为了猎奇，食用野生植物，从而把这些植物身上携带的病毒带到了人类社会，如本世纪初的非典病毒（Severe Acute Respiratory Syndromes, SARS）就是例子，这类新型病毒对公共卫生安康构成了庞大的应战，一般人的贪心，给全世界的人们带来了庞大的灾难。

当安康遭到了要挟，对付细菌，人类发明了抗生素， 对付病毒，发明了抗病毒药物，但要如何治疗，*步是找出元凶，而这在临床上往往存在困难。

传统的血惯例，或许器官和组织的影像学目的可以判别感染的能够性，但并不能作为确诊的依据，比如血惯例只能通知你能否有细菌或病毒感染，但不能通知你是什么细菌或病毒，还需求进一步反省才干确诊，以便有的放矢。

实验室反省，如抗原检测、核酸检测、代谢产物检测以及毒素检测才是明白感染、指点治疗和判别预后的重要手腕。

• 细菌和真菌检测。通常需求先停止分别培育，再结合生化反响停止鉴定，并进一步停止药物敏理性实验，这种形式是临床微生物实验室习用的经典形式，为临床处置了很多关键效果，但是其周期长、阳性率低、通量高等弊端往往难以满足临床日益增长的需求。
• 病毒、支原体、衣原体检测。难以像细菌一样停止分别培育，通常采用分子生物学方法如聚合酶链式反响（Polymerase Chain Reaction, PCR）测定核酸，灵敏快速，但只限于已知病原体的检测，且检测结果提供的信息相对有限，难以处置由变异带来的医学效果。

为了克制传统方法的缺乏，下一代测序技术（Next-generation sequencing technology，NGS）在病原微生物检测中的应用具有十分大的优势，如：

• 通量大，一次可检测成百上千个物种，特别是未知的病原，测定其核酸序列是必不可少的手腕；
• 直接测定病原微生物的核酸序列，能为临床提供准确的诊断依据，如物种鉴定、分型以及耐药突变等；
• 更低的检测限，即使病原微生物的丰度很低，也可以检测到。

当然，NGS的缺陷也是有的：

• 相关于PCR，时效性处于优势；
• 本钱较高，暂时不会完全取代现行的惯例鉴定手腕。

即使有缺乏，但NGS的技术优势更为清楚，在疑问微生物，以及难以培育甚至无法分别培育的少见菌属的鉴定，特别是新型病原微生物的爆发盛行监测方面，NGS快速、准确和高分辨率的特点，使其成为病毒鉴定的金规范，在盛行病学分型中发扬着重要作用。

新型冠状病毒（Corona Virus Disease 2019, COVID-19）正暴虐全球，目前尚无疫苗和*药，人们除了戴口罩，留意团体卫生以及添加社交距离外别无他法，面对汹涌的疫情，再一次提示人类，要放下自己是万物之灵的高傲，由于微生物才是当之无愧的地球*，它们在这个星球上生活的历史比人类更长，种类和数量也比人类要多得多。

我们不能，也不应该试图消灭一切微生物。我们之间的关系，不只要对立，还有协作，但是当我们的安康遭到要挟时，也要勇于妥协。

物竞天择，适者生活，人类与微生物的协作与妥协，必将永远停止下去。