（一）概述：NGS测序在病原微生物检测中的应用 生产盒装牛奶企业微生物检测哪些项目 检测步骤及所用培养基，培养时间是怎样的  健明迪

❝ NGS技术在临床上的运用逐渐趋于成熟，从早期的肿瘤基因检测，到如今大热的微生物病原核酸检测，NGS技术以其快速、准确和高分辨率的特点，发扬着无可替代的作用。 ❞

微生物在地球上无处不在，从陆地到陆地，从衣物到皮肤，甚至我们的身体外部。

繁衍、变异、自然选择和生活妥协，是一切生物必需阅历的。

由于生命的*要义，是生活。

为了生活，必需妥协，生物之间为了争夺资源，以及生物与自然环境之间，都存在着妥协 ，在这个进程中，有些微生物可以与人类战争共处，甚至互利共生，而有的微生物则会使人患病，通常有细菌、真菌、病毒、支原体，以及衣原体，这些就是临床上的病原微生物。

自然选择需求阅历漫长的进程，但是近年来环境污染，药物滥用，加快了病原微生物的退化速度，耐药菌，超级菌的出现，严重要挟着人类安康。

还有一些微生物，原本与人类没有交集，原先只存在于自然界，而有人为了猎奇，食用野生植物，从而把这些植物身上携带的病毒带到了人类社会，如本世纪初的非典病毒（Severe Acute Respiratory Syndromes, SARS）就是例子，这类新型病毒对公共卫生安康构成了庞大的应战，一般人的贪心，给全世界的人们带来了庞大的灾难。

当安康遭到了要挟，对付细菌，人类发明了抗生素， 对付病毒，发明了抗病毒药物，但要如何治疗，*步是找出元凶，而这在临床上往往存在困难。

传统的血惯例，或许器官和组织的影像学目的可以判别感染的能够性，但并不能作为确诊的依据，比如血惯例只能通知你能否有细菌或病毒感染，但不能通知你是什么细菌或病毒，还需求进一步反省才干确诊，以便有的放矢。

实验室反省，如抗原检测、核酸检测、代谢产物检测以及毒素检测才是明白感染、指点治疗和判别预后的重要手腕。

• 细菌和真菌检测。通常需求先停止分别培育，再结合生化反响停止鉴定，并进一步停止药物敏理性实验，这种形式是临床微生物实验室习用的经典形式，为临床处置了很多关键效果，但是其周期长、阳性率低、通量高等弊端往往难以满足临床日益增长的需求。
• 病毒、支原体、衣原体检测。难以像细菌一样停止分别培育，通常采用分子生物学方法如聚合酶链式反响（Polymerase Chain Reaction, PCR）测定核酸，灵敏快速，但只限于已知病原体的检测，且检测结果提供的信息相对有限，难以处置由变异带来的医学效果。

为了克制传统方法的缺乏，下一代测序技术（Next-generation sequencing technology，NGS）在病原微生物检测中的应用具有十分大的优势，如：

• 通量大，一次可检测成百上千个物种，特别是未知的病原，测定其核酸序列是必不可少的手腕；
• 直接测定病原微生物的核酸序列，能为临床提供准确的诊断依据，如物种鉴定、分型以及耐药突变等；
• 更低的检测限，即使病原微生物的丰度很低，也可以检测到。

当然，NGS的缺陷也是有的：

• 相关于PCR，时效性处于优势；
• 本钱较高，暂时不会完全取代现行的惯例鉴定手腕。

即使有缺乏，但NGS的技术优势更为清楚，在疑问微生物，以及难以培育甚至无法分别培育的少见菌属的鉴定，特别是新型病原微生物的爆发盛行监测方面，NGS快速、准确和高分辨率的特点，使其成为病毒鉴定的金规范，在盛行病学分型中发扬着重要作用。

新型冠状病毒（Corona Virus Disease 2019, COVID-19）正暴虐全球，目前尚无疫苗和*药，人们除了戴口罩，留意团体卫生以及添加社交距离外别无他法，面对汹涌的疫情，再一次提示人类，要放下自己是万物之灵的高傲，由于微生物才是当之无愧的地球*，它们在这个星球上生活的历史比人类更长，种类和数量也比人类要多得多。

我们不能，也不应该试图消灭一切微生物。我们之间的关系，不只要对立，还有协作，但是当我们的安康遭到要挟时，也要勇于妥协。

物竞天择，适者生活，人类与微生物的协作与妥协，必将永远停止下去。